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在理论框架创新的基础上，重大研究计划在研究手段和方法上也进行了大胆突破——针对研究数据质量不高、难以获得等问题，建立了向全球开放的“中国大气复合污染综合数据共享平台”，其规模之大、种类之全前所未有，增强了科学研究的透明度；针对我国该领域长期存在的模型“孤岛”问题，构建了中国首个开源共享模式“排放与大气过程集成耦合通用模式EPICC”，从源代码起全面开放，推动了该领域的科研范式从“小作坊式”向开放协同转变；针对大气垂直观测对先进且复杂的高精尖仪器的迫切需求，研发了“系留型超大载荷浮空器探测平台”，可将数百公斤甚至一吨的大型、先进仪器送入高空，实现对不同高度大气成分的实时、连续、精准测量。
